Original kannst du das über den Launcher machen.
Wenn du Enderal darüber deinstallierst, wirst du gefragt, ob du es sichern möchtest und Skyrim wiederherstellen
(falls du Skyrim bei der installation so gesichert hast).
Willst du auf Nummer Sicher gehen, machst du das ganze manuell.
Je nachdem wo du deine Sachen installiert hast, müstest du die ... anpassen.
- ...\Steam\SteamApps\common\Skyrim
(Installationsort des Spieles)
"%USERPROFILE%\Documents\My games\skyrim"
(Speicherort der Einstellungen und Spielstände)
"%USERPROFILE%\AppData\Local\skyrim"
(installierte Mods und deren Werte) versteckter Ordner!
...\Nexus Mod Manager\Skyrim
(Ablage der installierten Mods und deren Einstellungen) falls du den NexusModManager verwendet hast
Alles an einen sicheren Ort kopieren und die Sicherung ist fertig, danach deinstallieren/löschen der alten Installation
und Skyrim neu installieren.
Ebenso wäre das Löschen dieser Ordner eine Säuberung von eventuellen Installationsresten (nach kompletter Deinstallation),
aber auch deiner Skyrimsicherung durch den Launcher, denke daran!
Mehr dazu vieleicht
hier: