Nein. Die Skyrim SE ist ein 64 Bit Programm. Das ursprüngliche Skyrim auf dessen Engine Enderal basiert ein 32 Bit Programm.
Enderal müsste also dafür komplett umprogrammiert werden (womit eher nicht zu rechnen ist...).
Hast du z.B. bei Steam beide Skyrim Versionen wirst du feststellen dass Steam die auch beide als separates Spiel installiert. In dem Fall hättest du halt dein Vorteil Enderal und Skyrim SE ohne großen Aufwand separat installieren und spielen zu können.