Das deutet darauf hin, dass IDs in der Masterfile verändert wurden, nach dem du die Änderungen in einer ESP vorgenommen hast. Das CK merkt, dass die Version nicht mehr die ist, die es verändert hat.
Das kann man meistens umgehen, in dem man die FID/FUD Files löscht, das CK neu startet, deine ESP und die Master mitläd und die FID/FUD Files erneut erstellt. In dem Fall wird die Version in deiner ESP als die aktuelle erkannt.
Aufjedenfall aber sollte dieser Fehler eine Ursache haben, die man suchen sollte.